抗生剤の長期服用について

person10歳未満/男性 -

3歳になったばかりの息子は、引越しした先の近所の耳鼻科で滲出性中耳炎だろうと診断されており、2週に1度のペースで診察を受けています。
現在は、左耳に少し水が溜まっているのと鼓膜の色が悪いとのことで、クラリシッド・ドライシロップを朝食後のみ、ムコダインDSを朝・夕内服しており、14日間服用を3クール終了しました(1カ月半内服)。昨日、さらに同処方を14日分服用するよう指示がありました。
薬剤師さんから、「長期服用中だが体調に変わりはないか」尋ねられました。私自身も、抗生剤の長期服用が気になっています。
前地の耳鼻科の診察では(そこでも2週に1度診察してもらっていた)、抗生剤の長期服用はありませんでした。
かかりつけ医に直接お尋ねすればよいのですが、先生の指示を疑っているみたいに受け取られるのではと思い聞けませんでした。しっかり診て下さる良い先生です。
お忙しいところ申し訳ありませんが、処方通りに服用しても耐性菌などの問題はないか教えていただけるとあり難いです。
どうぞよろしくお願いいたします。

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