インフルエンザ後の咳について

30代/女性 - 2013/01/19

私は甲状腺機能亢進症(投薬なし・経過観察中)・囁声、機能性発声障害(トランサミン・ムコソルバン・ノイチーム・ムコスタ・ジルテックを服用中)の持病があります。

今月13日乾いた咳が続き熱は37度後半でした。
14日38度〜39度の発熱・悪寒・咳あり。
15日病院を受診。インフルエンザA型と診断され、ラピアクタの点滴・カロナール・アスベリンの処方あり。
16日朝平熱まで下がるも痰がからむ咳が今も続く。アスベリンが効かないのか、激しい咳込みで夜寝れず、食事の際は咳込んで出してしまい、呼吸が苦しい状態。
18日呼吸器科を受診。インフルエンザ後の気管支炎と診断され、濃厚ブロチンコデイン配合水薬とフロモックス、ムコダインを処方され服用。
19日便がゆるく、吐き気・お腹がゴロゴロしています。

・フロモックスor水薬が原因と思われる副作用?のような症状はありますが5日分飲みきった方がいいのでしょうか。(19日昼分のみ服用中止してます)抗生物質は途中で服用を中止すると耐性菌ができてしまうのでしょうか。
・インフルエンザの解熱後の咳は続くものなのでしょうか。過去に声が出なくなった事もあり、咳が収まらず声帯にも悪影響にならないか心配です。
・咳が出ている状態で21日から会社へ出社して周りに移ってしまう事はないでしょうか。現在家では私だけ別部屋で隔離されてますがいつまで隔離する必要がありますか?

たくさん質問してすみませんがよろしくお願いします。