抗生剤は全て服用すべきかどうかについて。

乳幼児/女性 - 2012/08/13

11ケ月の女児です。動脈管開存症があります。
2日前の昼から37,9℃の発熱があったのでこれからお盆休みに入るということもあり受診してきました。診察の結果、喉が少し赤くなっているから喉からきた風邪の初期だろうということでした。
心臓のこともあるため念のため、ムコイダンDS50%0,4グラムとセフゾン細粒小児用10%0,6グラムを1日3回で5日分処方してもらいました。今現在で7回分を服用したのですが、昨日の夜から便が緩くなり、今日は下痢を8回しました。
セフゾンの副作用なのでしょうか?
ただ受診前も午前中にいつもよりも少し緩いかなという便でした。
薬の影響ならば服用を中止したいのですが。
今は発熱も治まり、たまにくしゃみをするくらいで特に他にはありません。
しかし抗生剤は勝手に止めるのはよくないと聞いたこと、心臓のこともあるので下痢は我慢して服用しきった方がいいのか悩んでおります。
主治医に聞けるのが一番ですがお盆休みなので、どういうものなのか教えていただけると有難いです。