入院時のPCR。鼻腔検体と唾液検体の違い

person10歳未満/女性 -

12月に手術のため入院予定だった下の娘が
入院時のPCRで陽性になり
入院延期になりました。
11月8日にコロナ陽性になり
12月13日の入院時の鼻腔検体による
検査でct値39で陽性となりました。

ただ11月25日に東京都の無料PCRセンターで
唾液の検体でPCRを受けたところ
判定は陰性でした。
その後12月5日に上の子がコロナを発症。
その際は下の子はなんの症状もなく
上の子は発症日の夕方より私の実家に
完全隔離したので接点は発症の2日前から発症日まで。
日頃から習い事の関係で夕飯は別にとるので
接触があったのはおやつを並んで20分ほど一緒に食べたくらいとトイレとお風呂の共用くらいが考えられるリスクですがお風呂は下の子のが先に入るためリスクは少なかったと思います。

11月25日に陰性だったのが
12月13日に陽性になったのは
上の子のウイルスにより再感染していたと
言うことでしょうか。
それとも11月8日の感染時の
ウイルスの残りでしょうか?
それならなぜ唾液検体では出なかったのでしょうか。1時半ほど前に食事を済ませ
1時間前に歯磨きをしてそれ以降の飲食は
一切せずに唾液の採取をしにいきましたが
唾液の検体だとでなくて鼻腔だと出ると
言うことがあるのでしょうか。

来週再入院の為にまたPCRがあるのですが
まだ陽性の可能性もありますか?
唾液と鼻腔で違いがあるなら
入院前に無料の検査を受けて陰性確認しても
意味ないですよね?【新型コロナウイルス(COVID-19)についての質問】

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