腎盂腎炎の解熱後も尿から大腸菌が検出されました

person30代/女性 -

生後2ヶ月の時にグレード4の水腎症を持つ息子が腎盂腎炎になり入院しました。
発熱したその日に入院→点滴をし、2日後の朝には熱が下がり、その後熱が上がることはなく血中CRPも下がってきたので退院になりました。(原因菌は大腸菌ESBLでした)

しかし、退院して数週間経って実施した尿検査(膀胱から直接尿を取る検査)で、原因菌がまだ検出されたんです。
それまではワイドシリンを処方されていたのですが、そこからバクタに変更になり予防内服として毎日バクタを服用しています。

熱がなくとも原因菌(大腸菌)が尿から出ているうちは腎臓にダメージを与え続けるんでしょうか?熱性を伴わない腎炎もあるのですか?
感染から時間が経っているのに原因菌が検出されたので、腎臓にどんな影響があるのかとても不安です。

また、なぜはじめからバクタを処方してくれなかったのか理由が分からず(ESBL菌は耐性菌なのでワイドシリンよりバクタが良いと後から説明を受けました)ワイドシリンでも問題ないものなのですか?

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