クラミジアの再検査での陽性について

person20代/男性 -

11月の頭に排尿痛を感じ検査キットでの性病検査(TaqManPCR法)を行ったところ性器のクラミジアが陽性(喉は陰性)となりました。
アジスロマイシン1,000mgを1回処方して頂き、11/10に服用しました。
11/23に治癒確認検査を同様の検査キットで実施したところ、再度陽性の判定が出ました。ネット等で調べたところ薬の服用後2-3週間以内の場合死菌が反応して陽性となるというサイトもあったため以下確認したいです。

1.服用後、1週間程度で排尿痛の症状は消失したのですが、再検査の反応が死菌(偽陽性)ではなく耐性菌でまだ感染している可能性は高いでしょうか。
今回のケースで偽陽性は考えずらいでしょうか。

2.再検査での陽性を受けて、耐性菌の可能性ありとのことでミノマイシンを処方頂いたのですが、仮に偽陽性で完治していた場合でも、飲んで問題ないでしょうか。

3.3週間以上になる12/1以降に(もしくは4週間あけて)再度検査をしてみて、それで陽性が出る場合に薬を飲み始めるのは遅いでしょうか。(現在気になる症状はありません。)

ご回答宜しくお願いします。

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