9歳、咳と熱 抗生剤は必要でしょうか?

person10歳未満/女性 -

一日目
軽い咳が始まり、微熱も出ました。
二日目
37.7くらいの熱があり、元気もありました。
三日目
朝から40度の高熱があり1日平均して39.6くらいが夜まで続きました。少しぐったり。
四日目
朝38度くらいまで下がっていました。熱は上がったり下がったりの1日でしたが、回復傾向。が、咳が強くなってきました。痰が絡む音が聞こえるように。
5日目
熱は上がったり下がったり、でも元気が出てきました。が、夜の咳き込みが激しくなりました。痰を出せたら落ち着きます。
6日目
午前中平熱でしたが、午後になると38.2となり、治りが悪い気がして、近所の小児科へ。歩いて行けるほど元気がありました。
肺に音は入るけど、重篤な状態ではない無い、酸素も問題ないし、抗生剤飲んで様子見ましょう。と言われ、何の検査もしていませんが、ジスロマックを処方されました。

夜は微熱でしたが、処方通り薬を飲ませました。すると2時間後腹痛で苦しんでいました。
その後は眠ることができ、咳で何度か起きていました。
本日7日目
一日中平熱。
痰がからむ咳は有り。元気有り。

本日夕食後すぐ寝てしまい薬が飲めませんでした!
起こして飲ませた方が良いでしょうか?
昨夜の腹痛がまた起きる心配と、抗生剤は腸内細菌全滅って聞いたことがあるので、できれば飲ませたくないと思ってしまいます。
3日分処方されましたが、やはり、飲み切らないとだめでしょうか?

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