胃薬・オメラップ錠の服用について

はじめまして。胃薬の服用について少々不安なのでお聞きします。
私は市販の風邪薬と鎮痛剤の長期の飲み過ぎによる間質性腎炎からの腎不全と診断され約1年程前から腎臓の専門外来を受診しています。昨年の秋頃より胃の調子が悪くなった為今年2月に胃カメラをやったところ、胃潰瘍と十二指腸潰瘍ができておりピロリ菌の陽性反応が出てしまいました。早速ゲファニール50mgとオメラップ20mgが処方され3月5日より服用しています。薬に対してとても敏感になっておりオメラップについては少々強い薬ですと言われ処方されたので調べたところ、最長でも8週間を限度とし副作用は色々記載がありましたが生理不順(月経異常)とも書かれてありました。
その後胃の調子もかなり良くなってきたので気にせずそのまま服用していたところ、今月にはいって生理が不順になってしまいました。先月から約2週間後に生理が始まったので不安で先日の外来で伺ったところそのような副作用はないと思いますとの答えと、このまま飲みつづけたほうが良いでしょうとの答え。とりあえず10mgに減らし服用していたのですが、先日、今月2度目の生理(前回終ってから9日目)がきてしまいました。オメラップという薬は症状によっては8週間過ぎても服用するケースがあるのかという事と、副作用などについてお伺いしたいと思います。

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