抗生物質について

20代/女性 - 2014/10/18

1歳4ヶ月の男子です。
38度の熱をだし、小児科で座薬を処方されました。その後、熱は1日で下がりましたが、鼻水と咳が悪化し再度受診し、アスベリンシロップとカルボシステインシロップを3日分処方され飲み切りましたがよくならないので、今度は耳鼻科を受診しました。
耳鼻科では、ワイドシリン細粒200とビオフェルミンR散とアニミングシロップを4日分処方され飲み切り、よくなったので、再受診はしませんでした。

薬を飲み切り2週間後にまた熱が38度くらいでてしまいました。小児科を受診したところ喉が赤いとの事でした。鼻水の症状はありません。熱は1日程度でさがりました。
抗生物質をしっかり飲まないと耐性菌の影響で悪化したりすると聞きました。耐性菌の影響でぶり返してしまったのでしょうか？4日分は飲み切りました。
耐性菌ができてしまったのではないかと心配です。
よろしくお願いします。