副反応と風邪の違いは?

person乳幼児/男性 -

生後5ヶ月半の男の子です。
昨日、肺炎球菌3回目、ヒブ3回目、4種混合1回目の予防接種をしてきましたが夜になって38.5℃の発熱があり、その後39℃まで上がりました。
今朝は38.4℃で、接種をした病院で診てもらうと
「んー昨日の今日かぁ、もしかして潜伏してたかも?」
と言って聴診器をあて、風邪との診断で
解熱剤、抗生剤、胃腸薬をもらいました。

私はてっきり予防接種の副反応とばかり思っていたので驚きましたが、接種後約12時間での発熱は副反応ではないのでしょうか?
もしくは、聴診器をあてた時点で風邪とわかるような何かがあったのでしょうか?
ちなみに、聴診器以外には何もされておりません。

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