赤ちゃんの長引く血便について

30代/女性 - 2015/12/16

生後6ヶ月の赤ちゃんです。生後4ヶ月半になる頃から今日まで、 約2ヶ月近く血便が続いています。

9月末にロタウイルスのワクチンを接種し、その2週間後から血便が出始めました。ワクチン副反応の腸重積も疑われましたが、触診上問題もなく、機嫌もよく食欲もあるため様子見になりました。
その1週間後にRSウイルスに罹り、RSウイルスの治療をしていた間にも血便の量が増えたため、追加でアレルギー検査をしたところ、好酸球の数値が若干上昇していたのでアレルギーが疑われました。
抗アレルギー薬を飲み、ミルクもアレルギー用のミルクに切り替えましたが、状態が変わらないのでステロイドを3日間飲んだところ、血便が治りました。
血便が治まったので先週から離乳食をスタートしましたが、離乳食開始後2日目からまた血便が再発しました。
現在、抗アレルギー薬と整腸剤を飲んでいますが血便の状態は変わりません。機嫌や食欲は相変わらずよいです。

このままだとステロイドを再度飲むことになります。この治療を続けていて問題はないのでしょうか。2ヶ月も血便が出続けているので、内視鏡検査などをして根本的な原因を探るべきなのでしょうか。