生理不順か妊娠しているか

20代/女性 - 2017/05/11

前回生理が3月19日で、それから生理が来ていません。
以前にも同じ内容で質問させて頂きましたが、追加でお願いします。
元々生理不順で生理周期は30〜41日でした。
4月4日から数日不正出血がありました。
4月27日と5月7にゴムを付けて性行為をし、
5月10日にクリアブルーで検査したところ、陰性でした。
(以前に一年ほどピルを服用していました、現在は服用していません)
今日婦人科にかかったところ、経膣エコーをし、子宮内膜が18.5ミリなので
排卵が遅れてこれから2週間以内に生理が来るか、妊娠していて生理が遅れているかどちらかです
と言われました。
ピルを希望したのですが、以前自分で頸動脈エコーをしたところ右頸動脈の根元に2センチ程度の高エコープラークがありましたと先生にお話ししたところ
血栓ですか？血栓があるならピルはお出し出来ませんと言われました。
本当に血栓があるか、精査してくださいと紹介状を頂きました。
今日採血をし、妊娠しているか一週間後に結果が出ます。
今日かかった先生をまだ信頼出来ないので、他の先生方のご意見も聴かせてください。
生理不順を治し、避妊を確実にするためにはピルが一番だと思うのですが、血栓を考慮しやはり避けるべきでしょうか？
また他に生理不順を治して避妊を確実にしてくれるものはあるのでしょうか？
また妊娠の可能性はあるでしょうか？
まだ右頸動脈に高エコープラークはあると思いますが、ピル関係なく精査すべきでしょうか？
色々と文章がごちゃごちゃしてまとまっていませんが、よろしくお願いします。