薬は続けないといけないのか知りたいです

乳幼児/男性 - 2019/04/27

1歳9ヶ月息子の事ですが、
2日から保育園に通い12日から鼻水が出ており、時々黄色い鼻水に変わるを繰り返してました。21日に39.3℃発熱し、22日に２日間の抗生物質を出してもらいました。
23日に の昼には熱は下がりました。
24日の夜に熱がまた上がり、木曜には下がりました。事情あって、違う小児科に受診すると、抗生物質は5日間飲まないと行けないと言われ残り3日分頂きました。お薬手帳を渡してないので同じ種類のものか分かりません。
プラスで溶連菌怖いからと言われシロップももらいました。
昨日と今日で薬を飲んできたのですが、かなり嫌がり無理やり飲ませてるせいか食欲が落ち、便秘気味です。シロップも吐き出してしまいます。
その後耳鼻科も行き中耳炎はないと言われました。
現在の症状は、熱下がって以降変わらず痰、咳、鼻水です。
最初からベロが赤いなどもないです。溶連菌の症状はない気がします。溶連菌シロップ処方の病院では口の中は見てもらってないです。
食欲落ち体重も400グラム減っていました。ただ耐性菌も怖いので、どうしたらいいか迷ってます。溶連菌感染誤診だった場合飲んで大丈夫か知りたいです。