肺炎の直りが遅いと言われました

40代/男性 - 2020/09/19

レントゲンの画像を頂いたので再質問させて頂きます。
よろしくお願い申し上げます。（悪化してしまいました）
8/23
咳、胸痛で内科外来受診
体温37.4
レントゲンで肺炎と診断
マイコプラズマ陰性
CRP3.0
8/24
PCR検査受診。同日夜陰性判明
8/29
2回目診療
肺炎は明らかに小さくなってるがまだ残っている
クラビット服用開始2週間
CRP0.7
趣味のランニング再開OK
ただし息苦しくなったらすぐ辞めること。
8/30-9/14
趣味の週末ランニング再開。毎回10キロ3回。
合計30キロ走る。
2回目のランニングまでは特段異常を感じず。
9/14
10キロランニング後に軽い胸痛と咳が復活。体温36.6
外来へ。
肺炎が8/29から少ししか小さくなってない。
再びクラビット1週間
ランニング禁止
酸素飽和度98
9/15-18
37.0-37.6だったが、無理して会社に行く。階段で息切れするようになる。
9/19
熱が38.2まで上がり再診
CRP8.2上昇
酸素飽和度98％、脈拍120（早い）
肺炎の範囲が広がっている
薬変更　クラビット→ジェニナック
主治医が大きな病院への紹介をして頂くことになり、紹介先を探して頂いたが、どこも「肺炎患者はPCRで陰性が証明要」＋4連休ということで受入先なし。PCR検査その場で実施

現在は10分に一回位乾いた咳は出るが胸の痛みはなし。熱は36.8

ご質問
レントゲン見ると同じ場所が良くなったり悪くなったりしています。主治医は「肺炎のぶり返しだと思う。肺がんとかでは絶対ない」と仰って頂いているのですが、こういう経過を取る肺炎は安静にしていれば治りますでしょうか？
30キロ走ったり無理に会社に行ったり、肺炎を舐めており反省しています・・・