歯痛にて抗生物質を処方されました

30代/男性 - 2020/10/01

先日、上顎の親知らず含む虫歯の治療から歯痛が生じている事、顎や頬、頭痛などの痛みも生じている旨歯科医の先生にお伝えしたところ
親知らずを叩いても痛みが出ないなら炎症はおきていないと思うとの事で、副鼻腔炎の可能性を指摘され、歯が原因じゃないかもしれないので抜歯の前に耳鼻咽喉科を受診するよう指示されました。
その際にアモキシシリンというお薬を炎症を抑える薬と言われ処方されたので毎食後に飲むようにしました。
私は先日ピロリ菌の抗体検査で陽性だったため、一次除菌を二か月ほど前にして正式に除菌が成功したかどうかの判定はまだ受けていません。
アモキシシリンはピロリ菌の二次除菌に使う薬だとネットにて記載されていましたが、一次除菌が失敗していた場合に二次除菌用の抗生物質を単体で今飲んで、二次除菌が必要だった場合に耐性を持たれたりして失敗したりはしないのでしょうか？
むしろ中途半端に飲むのをやめずに処方された分を飲み切るのが良いのでしょうか？
よろしくお願い致します。