兄弟で夜中の激しい咳について

person乳幼児/女性 -

兄弟でおもに睡眠時のみ激しい咳が続いています。
2歳の子は2週間前に二日間発熱(38.5)しその後咳がずっと続いており、その1週間後4歳の子が鼻水などの風症状から咳が続いています。
起きている時の咳と鼻水はだいぶ良くなりましたが、昼寝の時と夜間寝入る前〜明け方まで激しい咳があり咳上げが何回か起こります。
小児科では心音など特に異常はないようですが、2歳の子は中耳炎を併発、4歳の子は気管支炎を疑いそれぞれ別の抗生剤を飲んでいます。
しかしあまり症状は改善されず、2人とも睡眠時の激しい咳が続いており寝れていません。
その間に父親に移ったのか、咳や声枯れがありましたが抗生剤を飲み改善しています。
今までも咳が続く事はありましたが時間が経つにつれて改善傾向で、2人とも激しい咳がずっと続いている事は初めてです。

そこで質問です。
 百日咳やマイコプラズマ肺炎などの感染症の可能性はありますか?
 呼吸器科にかかったほうが良いでしょうか?

長々と申し訳ありません。
ご回答、よろしくお願いします。

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