喉頭炎?インフルエンザ?

10歳未満/男性 - 2009/12/20

3歳の息子のことで質問です。
14日ごろからちょっと咳が出始め、16日には37℃だいの熱があり、いつもと違う咳だったので病院に行ったところ「喉頭炎」と診断され、吸入をしてもらい、薬を処方されました。
17日の昼は微熱があり、夜には38℃だいに上がり、18日の朝には微熱に下がりましたが、便も柔らかく、食欲もなかったので、また病院に行き薬をもらいました。
インフルエンザの簡易検査は陰性でした。
夜には39℃を超えました。
19日には、ますます咳が酷くなり、話す暇がないほどの咳で、また病院に行くと「喉頭炎の咳です」と言われ、吸入してもらい、インフルエンザの再検査をしたら、とてもとても薄〜く線がでました。
医師は「微妙だけど、インフルエンザといっていいでしょう｣ と言われました。
その日の夜、また39、9℃だったので、タミフルなどの薬と坐薬で寝かせ、朝には37℃に下がりました。

新型インフルエンザの場合は急な発熱と聞いてますが、息子の場合は急な発熱ではないので、インフルエンザではないような気がするのですが?
そして、なぜ熱が夜に上がって朝には下がってを繰り返すのでしょうか?

読みづらい文章で申し訳ありません。